PROBLEMI CON IL DEBUG DI ECLIPSE

Salve ragazzi non so se qualcuno di voi può aiutarmi.
Premetto che non sono un esperto di linux, quindi cercherò di spiegarmi... ho montato una distribuzione di Ubuntu (8.10) e sto su Kde4.1 per intenderci (figa l'interfaccia eh??)
Bene.. volevo estraniarmi dal mondo windows e quindi diciamo che avevo bisogno di tutte le applicazioni che avevo montato su winXp, tipo eclipse ad esempio. Ed è proprio su quello che cade il mio problema!
Bene, lo becco da Synaptic, becco anche le JRE che mi interessano... installo il tutto, lo accendo ed eccolo lì bello e pronto! Mi prendo il mio bel progettino, lo importo e volendo fare un po' di debug metto i miei bei breakpoint nel codice (JAVA) ma all'avvio del debug come solitamente facevo su windows... TAC... i breakpoint vengono saltati, cioè il compilatore li vede, li riconosce come breakpoint ma non mi apre il debug in automatico, e soprattutto non mi fa vedere le variabili man mano che scorre il programma... boh... sarà che sono ancora rimasto su windows e mi aspetto un po' di complicità dal sistema operativo... ma vi dirò che non ho capito realmente perchè fa così! Sono andato a vedere se avevo installato un debugger per eclipse e sembra che nell'istallazione del pacchetto (fatto precedentemente) non l'avevo selezionato e così ne ho trovato uno sempre su synaptic e l'ho scaricato e installato ma cmq il debug non va come dovrebbe andare... qualcuno mi sa dire il perchè?? Non mi va di ritornare su windows solo per un futile motivo..