LABORATODIO DI BIONINFORMATICA (HELP)

Salve a tutti,
avrei un piccolo problema con il laboratorio di Bioinformatica dovuto alla mia assenza nelle ultime ore di lezione. Mi hanno detto che l'assistente ha spiegato come usare i programmi BLAST e FASTA che, come sto leggendo su internet, sono due programmi per la ricerca di similarità tra proteine.. uno (FASTA) che allinea la proteina in input con tutte quelle che stanno su di un database, naturalmente cercando la similarità solo con sequenze della stessa famiglia proteica, l'altro (BLAST) ne prende due in input e in maniera sempre statistica li allinea... purtroppo non so bene ne dove trovarli, ne come usarli. Qualcuno è così pio da potermi dare qualche dritta direttamente quì nel forum?? Ve ne sarei immensamente grato visto che mancano davvero pochi giorni all'esame!

GianMaria ha scritto:

Salve a tutti,
avrei un piccolo problema con il laboratorio di Bioinformatica dovuto alla mia assenza nelle ultime ore di lezione. Mi hanno detto che l'assistente ha spiegato come usare i programmi BLAST e FASTA che, come sto leggendo su internet, sono due programmi per la ricerca di similarità tra proteine.. uno (FASTA) che allinea la proteina in input con tutte quelle che stanno su di un database, naturalmente cercando la similarità solo con sequenze della stessa famiglia proteica, l'altro (BLAST) ne prende due in input e in maniera sempre statistica li allinea... purtroppo non so bene ne dove trovarli, ne come usarli. Qualcuno è così pio da potermi dare qualche dritta direttamente quì nel forum?? Ve ne sarei immensamente grato visto che mancano davvero pochi giorni all'esame!

ciao, il prog lo trovi qui http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
puoi inserire sia la sequenza in formato FASTA, sia l'id della proteina.